Pago horas extras en organismo colaborador de mejor niñez

Mi relación laboral en con un organismo colaborador acreditado de mejor niñez (OCA). Cuento con contrato indefinido desde hace algunos años. En el contrato de trabajo no se hace referencia al pago de horas extras, pero contamos con un reglamento interno de orden higiene y seguridad, que señala que la organización no paga horas extras, sino que compensa con devolución del tiempo extra invertido en el trabajo. Yo he hecho una solicitud de pago de horas extras porque entiendo que el Código del Trabajo indica que las horas extras deben ser canceladas y no se si dejar constancia en la inspección del trabajo por el no pago de lo descrito.